大量の動画ストレージはいいとして、ファイル管理はどうしてますか？

MkLinkでジャンクション張って複数のHDDを一つのフォルダに仮想的に
連結してると、どうもFenrirFSではファイルのIDがぶつかるようで、一部のファイルが
出てこなくてどうしたものかと・・・