そら、生物である以上はホモサピエンスだろうが、何だろうが遺伝子が重なれば遺伝病の危険性は高まるからな
親子や兄妹で永遠に自家生産せずに他家の血を入れる必要性があるなら、ちょっとは近親相姦の影響はあるという経験則や本能的な忌諱があるという解釈だよ
まあ、政治的な理由によって他家の血を入れる必要があるという理由もあるけど、それはそれでデメリットがあるし。自家での自己生産が安全牌
もし近親相姦による悪影響が一切ないなら、他家の血を入れるのは最後の手段になるべきであって、近親相姦が最後の手段になるのはおかしいからね
ファンタジーだし、作者はそんな細かいこと考えてないと思うから別に気にしてないし
そんなことで面白さが減るわけじゃないけど
敢えて答えを出すなら、多少は影響があるんじゃないのってだけの話
書いてない要素を読み取るのが幻想で、それがダメなら、そもそも考察なんてすべきじゃないんじゃない？
アテラハンで内部分裂が起きるか否かとかね
作中で確定していないなら、すべて妄想だよ