まあ、普通に割烹を読めば
近親交配が特に問題にならないのは、主祖の体が魔力のおかげで頑丈だから、多少先天的に体が弱くても大して問題にはならないからであって
そもそも遺伝疾患の類が存在しないということにはならんでしょ

ちなみにカルミアは遺伝子関係ではなく、カーチャンが身籠ったまま魔獣と戦ったせいというのが有力