「番組名「を」よく変更してました」「番組名がよく変更「されて」ました」
表現の仕方は色々あるが「番組名がよく変更してました」これだけは違う。
「番組名」に手が生えて変更を加えたわけではなく変更を加えたのはその他（人間）なのだから
「番組名「を」（人間が）よく変更してました」
または「番組名がよく（人間によって）変更されてました」とならなければおかしい。