こちらはバグですね。あっちを直してこっちが悪くなるという典型的なデグレ症状。じっくり直さないとだめですね。
回避するには読み込み前に一度 Ctrl+Shift+M で無効化して読み込みを行って、もう一度 Ctrl+Shift+M を押して再適用してください。
>>851
56 の cf_J_Mune02_t など _t がついているボーンは位置調整用のボーンっぽいのでスケールを変えるとおかしくなるかもしれません。
65 の J_siri についてはもともと 10 とか非常に大きくしないと見えないくらいの変化量です。動かないようなら値を変えてみるとか。