アンチウイルスソフト何使ってるか知らないけど、
それがゲームファイルをウイルスだど誤判断して勝手に必要なファイルとか消されてる感じかなぁ
>起動→閉じる
ここで必要なファイルがないから起動できない感じだし
>通常で遊べる→閉じる→パッチがフォルダから消える
パッチがフォルダから勝手に消える？ってのもなんかおかしい
アンチウイルスソフト切って試してみて
アンチソフトの誤動作が確実ならそのアンチウイルスソフトに「このゲームファイルはウイルスじゃないから消さないで」って設定してやらなきゃいけないけど
そのスキルがなかったら他のアンチウイルスソフトに乗り換えるしかないねw