プレホファイルの読める最古版のSB3Uと最新版も、あの手順で問題なかったです
原因がわかりません
一応、メッシュをmqoではなく、fbxのものも置いておきます
http://www.mediafire.com/file/l74k3cqm42i9p4r/TrainsBottoms_fbx.zip/file
これでダメなら、あきらめしかないと思います
fbxの場合、手順が変わるのは・・
>>212
3.xxx.mqoではなくxxx.fbxに拡張子が変わります
4.yuka.fbxタブ内のImportedMeshの下のmo_ph_map_yuka_00をObjectTree内の当該フレームへドラッグ&ドロップ、
ポップアップは>>212の画像だとNormalsがCopy Nearrestが選択されてますが、それはReplaceにしますけど、
既にそうなっていると思います。後は>>212の画像の通りでOKです
5.の作業は不要になります（上記でNormalsをReplaceしたので、再設定は不要）
Kiiro.fbxの方は>>216のメッシュを入れるフレームを作ってから、全く同じ要領で作業します