LREのF5メニューがneoで表示されない原因を特定できました
Plugin内のallegretto.dllを削除したところ正常に表示されるようになりました
また、バージョン1.4.2から1.4.1にダウングレードしたところ２つのmodを両立させることができました

２つのバージョンの差異は

・画面効果の初期値を設定できるようにした（デフォルト全OFF）
・デフォルトライトをOFFに設定できるようにした（デフォルトOFF）

というものなので恐らくここで何か問題が起きていたと思われます