>>65
インポート/エクスポート時にメッシュの座標が変更されてたりしない？
SB3Utilityから出力した直後のfbxとBlenderで出力した後のfbxそれぞれをBlenderで読み込ませた時にどうなってるか？
もし同じだった場合はSB3Utilityから出力する時のフォーマットのfbxのVerの確認
あと、Blenderのインポート/エクスポート時のオプションの確認