色々試しましたところ、コントローラを起動した状態でのSA切替と、コントローラの二重起動による同時連動に成功しました！！！
私の場合、以下のような結果でしたが、個人の環境により優先順位は逆転すると思われます。
・A10接続 → コントローラ起動 → UFO接続 ・・・A10 ○ → A10 ×、UFO ○（UFOにスイッチされる、再度A10への切替は不可）
・UFO接続 → コントローラ起動 → A10接続 ・・・UFO ○ → UFO ○、A10 ×（UFOのまま変わらない）
・A10接続 → A10コン（1）起動 → UFO接続 → UFOコン（2）起動 ・・・A10 ○、UFO ○ （（2）は別のCOMポートに接続される）
・UFO接続 → UFOコン（1）起動 → A10接続 → A10コン（2）起動 ・・・UFO ○、A10 × （（2）はCOMポートに接続されない）
モード記憶機能、問題ありません。UFO停止バグ改善されています。回転方向の色分けとても見やすくなりました。COMポート表示機能、接続状況が分かってとても便利です。
カンペキです。(≧▽≦)ノ