こちらでは問題が続くようです。
簡単に再現できる方法は次のようです。
BlenderでHITOMI_FACE.TMCをロードします。
無表情の状態のままでcsvでMotion CSV exportします。

Kokoro Paradise.MPMに適用後Hitomi->Kokoro変換します。
BlenderでKOKORO FACE.TMCロード後に
Motion MPM Importします。
http://imgur.com/wzaTKIm.jpg