MOの右窓にあるファイル表示一覧で何が反映されてるかわかります
それがゲームに反映されてない場合はoverrideフォルダからファイルを引きずり出して
Zip化してMODにしちゃうか、他のMODに上書きする（勿論優先度の高いMODに）