tmd内のモデルを制限付きでいじれるコンバーターを作りました
http://ux.getuploader.com/sk_mod/download/31

骨との関連付けが壊れるため頂点、ポリゴンの追加、削除は一切できませんが
こんな感じで縮小して見えないところに埋め込むことでパーツの削除や
突起の作成、頂点のスナップ機能で水着の段差を埋めてテクスチャ修正すれば裸体と
気合があれば結構なことができると思います
http://imgur.com/a/w0Ohz
http://imgur.com/a/akQ0r

モデル編集のソフトはメタセコイア無料版でここからダウンロード可能です
http://www.metaseq.net/jp/download/