HDT-PE(Physics Extensions)はボーンでの物理演算をサポートする、エンジンはHavok
Havokは32bit用のライブラリを公開していたが64bit環境では無償で提供していない
よってPEはSEでは動かない

HDT-SMP(SkinnedMeshPhysics)はクロスシミュベースの物理演算で
上記の理由でエンジンは64bit環境ではHavokが使えないためにBulletを使っている、SE環境向け

HDT氏は既にskyrimから他に興味が移っており
手間を嫌ってるのでお膝元の9dm以外では積極的に活動していない
LE版向けの更新が止まっているのも作者のモチベーションが無いから

更新があるだけでもありがたいのにライセンス違反扱いはちょっと酷くね、どこから出てきたのその話