Even Actors Heightは、
NPCの個別のパラメータの「NAM6 - Height」を強制的に「1」に戻す仕組み

Race設定で種族ごとに統一設定されているHeightや
RaceMenuでスケルトンのルートのサイズを個別に変更している場合は
Even Actors Heightよりも優先されるし
当然スケルトンのnifをいじっているフォロワーMODには影響ないはず