僕もfooterの下に設置してきました。
それでも結構存在感があったのでサイズを０にしてみました。

記事は全部直して行くとかなりの時間がかかるので次回の更新から気をつけたいと思います。

ところでサイドバーに過去記事を人気順ではなく
ランダムにサムネイル付きで表示させたいのですが、
なにかいい方法は無いでしょうか？

自分で調べたらWordPressのRandom Image pluginてやつが出てきたんですが
さすがにFC2のプラグインとして使えないですよね？