書庫をひっくり返す余裕がないので、とりあえず思いついたものをいくつか
公式の詳細検索の登場人物年齢が18歳が下限になっていたり、登場人物職業に中学生がなかったり、裏を取れないので間違っていたらご勘弁

書院文庫だと、兄妹相姦モノの妹（義妹）キャラに中学生が出てくることが多かった印象がある
たとえば、岡部誓のデビュー作「兄と妹と女教師」、櫻木充「美母の手紙・妹の恋文」の妹キャラが中学生
櫻木充が兄妹相姦が多かったから、他にも中学生妹キャラが出る作品があったはず

他にはけっこう長めのスパンで性遍歴を綴るなかで中学生時代が語られるパターン
麻田龍太郎の「私の禁忌日記」、舘淳一の「養女」とか

神瀬のハーレムモノにも中学生がいたのもあったはずだけど、公式の著作一覧を見てもピンとこなかった（劣化してるなぁ・・・記憶）