1.IPA3.3フォルダ内のIPAフォルダ・IPA.exe・Mono.Cecil.dllの3つ全てStudioNEO_64.exeと同じフォルダに置く
2.StudioNEO_64.exeをIPA.exeにドラッグ＆ドロップする
3.エラー表示が無くIPA.exeが終了したらStudioNEO_64 (Patch & Launch)が生成される

手順が3つしかないから上手くいかないともう他に試すことが無い…