こんな感じで。
ffmpeg -hwaccel nvdec -i %1 -vcodec h264_nvenc -vf bwdif -b:v 6M -maxrate:v 6M -preset slow -profile:v high -level 5.1 -rc vbr -cq 25 -acodec aac "r:\%~n1".mp4
javplayer -i "r:\%~n1".mp4 -f TG-AFx-1-batch1 SR-VBPP -batch2 none -tgpath d:\TG -enc "NatCorder/HEVC" -o "r:\%~n1_VBPP".mp4
指定されてないパラメータはjavplayer.udjから引っ張ってきてもらう。
思いつきで書いたから適当だけどね。