Bepin環境導入についてどう説明するかややこしい部分があり悩んだんですが
まず最初にMODを導入していないまっさらなバニラ状態から導入する説明をしようと思います
最近プレホを始めた人向けとしても良いような気もしますし
すでにMOD環境を構築している場合のやり方は後述します

あんまり考えたくないですが、プレホ環境をぶっ壊して最初から構築し直す場合を想定して
その際に再インストールする手間を省くために、まっさらな状態のPlayhomeフォルダごと
コピーしてバックアップをとっておくのもいいかもしれません

また、すでにMOD環境が整っている場合でも新たにMODを導入する際には念のために
Playhomeフォルダごとコピーしてバックアップしておけば後悔することなく巻き戻せます、めんどいけどw
そこまでしなくても定期的にゲームが動く環境でまるごとバックアップはしたほうがいいでしょう
取り返しの付かないことをやらかして環境をぶっこわしたら嫌でも学ぶことなので要らん忠告かもしれませんが

で、Bepinプラグインはゲーム本体のデータの書き換えを行わないのですが同時に
IPAパッチとかMOD追加に必要なMoreSlotIDとかキャラエディットの数値を限界突破するPH_WideSliderといった
データを書き換える系のパッチは代わりがあるので要らなくなります
新たに環境構築する場合はむしろこの3つは入れないでください
特にMoreSlotIDとPHMoreSlotID.BepInExは両方入れるとゲームスタートした瞬間にT時ポーズの生首ボディが
表示された状態でフリーズする事態になりますので絶対にやらないでください(詳しいことはの後ほど書きます)