ここで丁寧に説明してもらったのをきっかけに
BepInExに手を出してみました
MessageCenter/IPALoaderX/Modding API辺りだったかな
いくつか取りこぼしたプラグインもありましたが
取り急ぎ導入した分でHSmodの色が反映されない件は
いくらか無くなりました
sakさん（お気に入りmodの筆頭）の水着系が
やっぱりデフォ色に戻ってしまった（スカートとかは反映されるようになった）
ので足りていないプラグインの分の影響なのかなと
追々不足分も補って困ったことがあったら、また相談させていただくかもしれません
説明並びにアフターケアまでお手数かけました
本当にありがとうございます